R. Raphael was elected rabbi of Pisa in 1722. In 1729 he was elected to succeed R. Isaac da Costa as chief rabbi of Bayonne and St. Esprit, and he remained Hakham of these congregations until 1741, when he returned to Leghorn.

R. Meldola was the author of a large number of theological and ethical works, the most important being Mayim Rabbim, and his responsa, in several volumes, which gained for him a European reputation, and which were afterward published by his son R. David in Amsterdam. He married in 1701 Rachel Meldola, the daughter of his uncle Abraham, by whom he had seven children. His third son, R. David, and his youngest son, R. Moses Hezekiah, became very distinguished rabbis. His second son, Abraham, born in Leghorn 1705, was a noted typographer.

הסימנים לד-לח בחלק אורח חיים, הלכות עירובין, נדפסו קודם לכן בקונטרס מיוחד בשם "פרשת העיבור", אמשטרדם תצ"ד. הנדון הוא "עיר אחת שכולה גוים" (העיר באיון) כיצד יטלטלו בה בשבת. הסכמות (בחלק א): ר' דוד ישראל עטיאס ור' יצחק חיים ן' דנא די בריטו, אמשטרדם, יתרו תצ"ז; ר' אלעזר [רוקח] מקראקא, אמשטרדם, ד כי תשא תצ"ז; ר' משה ב"ר אלעזר [רוקח], אמשטרדם, ו כי תשא תצ"ז; ר' יוסף ב"ר שמעון עקיבה בער ור' משה ב"ר שמעון פרנקפורט, אמשטרדם, אחרי מות תצ"ז; רבני ליוורנו: ר' אליעזר הכהן, ר' יוסף עטיאס, ר' גבריאל דיל ריאו, ר' דוד ב"ר אברהם מילדולה ור' מלאכי ב"ר יעקב הכהן, תצ"ז; ר' יחזקאל ב"ר אברהם מבית קצנאלפוגין, אלטונא המבורג וואנזיבעק, יב סיון תצ"ז; שלוחי צפת: ר' חיים יעקב [ב"ר יעקב דוד] ור' מאיר די סגורא, ראש-חודש חשון תצ"ח.