R. Spira was born in Cracow, where his father was a dayyan. His grandfather, after whom he was named, was the author of Megalleh Amukkot. R. Spira served as rabbi in several locations in Poland prior to settling in Eretz Israel, where he became rabbi of the Ashkenazi community. After tah ve-tat (the Chmielnicki massacres of 1648-49) he went to Europe to raise funds for the Jewish communities in Eretz Israel, which suffered due to a decline in support because of the devastation in Europe. Among the communities he visited was Amsterdam, where his influence caused Menasseh Ben Israel to bring the plight of Polish Jewry to Oliver Cromwell’s attention. Although he returned to Jerusalem, Spira again traveled to Europe, where he died in Reggio, Italy.

לכל חלק שער מיוחד. בהוצאה זו נשמטה הקינה "אור הגנוז בלובן המחשוף" לר' משה זכות. חלק א: על מעלת ארץ ישראל. [4],מא דף. חלק ב: ביאור המשניות דעשר קדושות. [1],כח דף. חלק ג: שפר תיקונים, חלק שלישי מספר טוב הארץ; סדר תיקון חצות ... סדר תיקון (ליל) שבועות והושענא רבה ... והוספות תיקון יסוד מהאר"י ז"ל (שהרב המגיה בדפוס זאלקווא הוסיף ... מתלמידי האר"י ... והוא ענין ... סוד נעלם ... לחשוב בשעת שהוא מוהל ... מועתק מכתיבת יד מהור"ר ליב מפלעבנא), ושאלת ר' בנימין הכהן ותשובת רבו הרמ"ז [ר' משה זכות] אליו (בסודות המילה [הועתקו בהשמטות מספר אגרות הרמ"ז, ליוורנו תק"ם, דף יח,ב-יט; כב-כד,א בתוספת שינויי נוסחאות ב"סדר הכוונה בקצרה" למוהל שנכלל בתושבה הנז', על-פי ספר סוד ה' לר' דוד מלידא , מנטובה תק"ג]), והפזמון: מי זה הקדים (או מי שלם מזער על רוב חסדי צורו ... חברו ... הרמ"ז זצלל"ה ... וחברת משמרת הבן ... שלפני המילה ... נוהגין לומר ... הפזמון הזה [אוצר השירה והפיוט, ג, עמ' 117, מס' 1061]), ועוד הוספות: מפתח מבוא שערים [לר' חיים וויטאל] מרב (מוהר"ם [ר' שלמה משה]) סוזין (שזיכני ה' אותו עם הגהותיו ... ועשה ... מפתחות ... לספר דפוס קושטא [צ"ל: שאלוניקי תקס"ו] ... מה שחסר פרקים וחלקים שלימים ואולי גם שערים שלמים חוץ מה שחסר בפנים הפרקים הנדפסים) ומפתח (לספר מבוא שערים) מהר"ן [ר' נתן] שפירא זללה"ה (ראיתי ... בכ"י ... שהיה ביד הר"ן שפירה[!]... אמרתי יהיה נא חלקי עם מזכי הרבים ולתת פה מקום להמפתחות הנ"ל) (הוספתי בסוף, מפתחות הספר כולו טוב הארץ עם הוספותיו). [1], כה דף. בחלק ג (דף יא-יג,א) הוספה שאינה נזכרת בשער: "מעשה נורא הועתק משל"ה [שני לוחות הברית]... מכתב ... ר' שלמה אלקביץ ... וזה נוסח הכתוב: דעו לכם כי הסכמנו ... לעמוד על נפשינו ליל שבועות ולנדד שינה מעינינו". נדפס לראשונה בספר מגיד משרים, חלק א, לובלין ת"ו.